Το Πρυτανικό Συμβούλιο έχει εκτελεστικές αρμοδιότητες που αφορούν καθημερινά ή τρέχοντα ζητήματα, οι οποίες του παραχωρούνται από:
    • Τη Σύγκλητο μετά από πρόταση του Πρύτανη
    • Το Συμβούλιο μετά από πρόταση του Προέδρου του Συμβουλίου
 
Συγκεκριμένα, το Πρυτανικό Συμβούλιο έχει, μεταξύ άλλων, τις πιο κάτω αρμοδιότητες:
    • Διορισμούς Ειδικού Εκπαιδευτικού Προσωπικού, Εδικών Επιστημόνων, Επισκεπτών Καθηγητών και Μεταπτυχιακών Συνεργατών
    • Αιτήματα για παραχώρηση Σαββατικής Άδειας
    • Αιτήματα εισαγωγής υπεράριθμων φοιτητών
    • Αιτήματα απονομής μεταπτυχιακών διπλωμάτων
    • Απαλλαγές από δίδακτρα
Το Πρυτανικό Συμβούλιο αποτελείται από τα ακόλουθα μέλη:
    • Τον Πρύτανη (Πρόεδρος)
    • Τους δύο Αντιπρυτάνεις του Πανεπιστημίου
    • Τον Διευθυντή της Διοίκησης και Οικονομικών