Οι μεταπτυχιακοί φοιτητές Χημείας διεξάγουν την έρευνά τους σε ερευνητικά εργαστήρια, τα οποία έχουν δημιουργηθεί από τους υπεύθυνους καθηγητές / ερευνητές του Τμήματος στα προαναφερθέντα ερευνητικά αντικείμενα. Τα ερευνητικά αυτά εργαστήρια έχουν εξοπλισμό συνολικής αξίας περίπου 2.000.000 ΛΚ. Ο εξοπλισμός αυτός αγοράστηκε κατά την περίοδο 1993-2006 από τον προϋπολογισμού του Πανεπιστημίου (Κρατική χορηγία) καθώς επίσης και από ερευνητικά προγράμματα του Ιδρύματος Προώθησης Έρευνας (ΙΠΕ) και της Ευρωπαϊκής Ένωσης.

Στο σημαντικότερο ερευνητικό εξοπλισμό του Τμήματος συγκαταλέγονται:  

• Φασματογράφος Πυρηνικού Μαγνητικού Συντονισμού (300 MHz ΝΜR)
• Συσκευή Περίθλασης Ακτίνων Χ (XRD) για δείγματα σε μορφή σκόνης
• Συσκευή Περίθλασης Ακτίνων X (XRD) για μονοκρυστάλλους
• Συστήματα αέριας χρωματογραφίας / χρωματογραφίας μάζας (GC/MS) / in situ υπέρυθρης φασματοσκοπίας (DRIFTS) για τη μελέτη καταλυτικών αντιδράσεων
• Συστήματα για in situ λήψη φασμάτων UV-vis/DRS και Raman σε στερεά υλικά υπό συνθήκες καταλυτικής αντίδρασης.
• Συσκευές μέτρησης πορώδους στερεών με ρόφηση αζώτου
• Συσκευή θερμοσταθμικής ανάλυσης (TGA)
• Υγρή χρωματογραφία/χρωματογραφία διείσδυσης πηκτής (HPLC/GPC) για χαρακτηρισμό πολυμερών
• Στατική και δυναμική σκέδαση φωτός (SLS και DLS)
• Θερμιδόμετρο διαφορικής σάρωσης (DSC)
• Συσκευή Langmuir-Blodgett για παρασκευή λεπτών υμενίων οργανικών μορίων
• Ιοντικός χρωματογράφος
• Φασματοφωτόμετρα ορατού-υπεριώδους και υπερύθρου (UV-vis, FTIR), φθορισμού και ατομικής απορρόφησης
• Πλήρης σειρά ηλεκτροχημικών οργάνων, με ποτενσιοστάτες, κυκλική βολταμετρία, πολαρογραφία, μικροζυγό χαλαζία (QCM), αγωγιμομετρία και πεχαμετρία
• Οπτικό και πολωτικό μικροσκόπιο
• Σύστημα Resonance & Time-Resolved Resonance Raman (Nd: YAG lasers +0.75m Φασματογράφος με LN2.cooled CCD camera ως ανιχνευτής)
• Σύστημα Time-Resolved fluorescence (Intensified gated CCD Camera)
• Μαγνητικός ζυγός
• Στοιχειακός αναλυτής C, H, N, και S
• Δυναμικός αναλυτής μηχανικών ιδιοτήτων στερεών υλικών
• Αντιδραστήρας μικροκυμάτων
• Αέριος χρωματογράφος (Shimadzu, HP)
• Αναλυτής ΝΟΧ (chemiluminescence)
• Αναλυτές υπερύθρου CO, CO2 και CH4
• Αναλυτής Η 2
• Εξειδικευμένα συστήματα ροής αερίων για διεξαγωγή καταλυτικών δυναμικών πειραμάτων (Catalytic Transient Experiments) και μελέτες μηχανισμού καταλυτικών αντιδράσεων με χρήση ισοτόπων αερίων.
• Μικροσκόπιο ατομικής δύναμης, μοντέλο PicoPlus της Molecular Imaging (Agilent)
• Σύστημα Ηλεκτροφόρησης Τριχοειδούς (PrinCE-C, 760)
• Συζευγμένο Σύστημα Ηλεκτροφόρησης Τριχοειδούς - Φασματογράφου Μάζας (Agilent, G1600A & Agilent, 6110 Quadrupole LC/MS system)
• Σύστημα Υγρής Χρωματογραφίας Υψηλής Απόδοσης (Shimadzu, LC-20A/10A)