Το Γραφείο έχει την ευθύνη για την ορθή εφαρμογή της περί Φ.Π.Α. Νομοθεσίας στις συναλλαγές του Πανεπιστημίου Κύπρου, την ετοιμασία των τριμηνιαίων δηλώσεων Φ.Π.Α. και των μηνιαίων δηλώσεων INTRASTAT και VIES, καθώς επίσης και για την παροχή υποστήριξης στην Πανεπιστημιακή Κοινότητα για θέματα που άπτονται του Φ.Π.Α.. Οι αρμοδιότητες του Γραφείου περιλαμβάνουν επίσης την Κοστολόγηση Δραστηριοτήτων και Οργανωτικών Οντοτήτων και την ετοιμασία μελετών για σκοπούς Διοίκησης. Πέραν των πιο πάνω, το Γραφείο είναι αρμόδιο για την οικονομική διαχείριση Συμβολαίων Παροχής Συμβουλευτικών Υπηρεσιών και άλλων Ακαδημαϊκών Δραστηριοτήτων, καθώς και για την παροχή υποστήριξης σε Σωματεία και Εταιρείες του Πανεπιστημίου Κύπρου.