Σκοπός των μεταπτυχιακών προγραμμάτων στο τμήμα ΠΜΜΠ είναι η εξειδίκευση και η προώθηση της βασικής και εφαρμοσμένης έρευνας, η καινοτομία και η διάχυση επιστημονικών αποτελεσμάτων. Τα μεταπτυχιακά προγράμματα του τμήματος ΠΜΜΠ έχουν κυρίως ερευνητικό προσανατολισμό για να υποστηρίζουν και να ενδυναμώνουν τις ερευνητικές και εκπαιδευτικές δραστηριότητες του τμήματος και του πανεπιστημίου και την προώθηση της καινοτομίας στη χώρα. Η έρευνα εστιάζεται σε τομείς που εξυπηρετούν τις ανάγκες και τα συμφέροντα της κοινωνίας, αναγνωρίζοντας και δίνοντας λύσεις σε τοπικά και διεθνή προβλήματα και προωθώντας ευκαιρίες για ανάπτυξη και βελτίωση της ζωής στην Κύπρο.
Το Τμήμα ΠΜΜΠ δέχεται κάθε χρόνο μεταπτυχιακούς φοιτητές στα επίπεδα Μάστερ (M.Eng., M.Sc.) και Διδακτορικού (Ph.D.). Οι φοιτητές έχουν δικαίωμα επιλογής μεταξύ των δύο τίτλων σπουδών M.Sc. ή M.Eng. Ενδιάμεση αλλαγή από τον ένα τίτλο σπουδών στον άλλο επιτρέπεται μετά από αίτηση του φοιτητή και έγκριση του Συμβουλίου Τμήματος. Το Συμβούλιο Τμήματος έχει το δικαίωμα της υποχρεωτικής αλλαγής από M.Sc. σε M.Eng. σε περίπτωση μη ικανοποιητικής προόδου του φοιτητή στην έρευνα διατριβής και μετά από πρόταση του ερευνητικού συμβούλου του φοιτητή.