Η Σχολή Μεταπτυχιακών Σπουδών διοικείται από Κοσμήτορα, Αναπληρωτή/τρια Κοσμήτορα και το Συμβούλιο της Σχολής.
Το Συμβούλιο της Σχολής αποτελείται από:
- Τον/Την Κοσμήτορα της Σχολής Μεταπτυχιακών Σπουδών (Πρόεδρο)
- Τον/Την Αναπληρωτή/τρια Κοσμήτορα της Σχολής Μεταπτυχιακών Σπουδών
- Ένα μέλος της Επιτροπής Μεταπτυχιακών Σπουδών κάθε ακαδημαϊκού Τμήματος
- Εκπρόσωπους των μεταπτυχιακών φοιτητών/τριών
Ο/Η Κοσμήτορας της Σχολής ετοιμάζει τον προϋπολογισμό της Σχολής και έχει ως κύρια ευθύνη την:
- Ανάπτυξη των μεταπτυχιακών προγραμμάτων του Πανεπιστημίου
- Παρακολούθηση του αριθμού και της ποιότητας των φοιτητών/τριών
- Εύρυθμη λειτουργία και οργάνωση της Σχολής
